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sh00ter.
Sicuramente usare un set di batterie con una diversa storia di carico/scarico non è mai ottimale. Se le batterie fossero in parallelo, la batteria più nuova andrebbe a caricare quelle più vecchie. Se le batterie sono in serie, come nel tuo caso, credo, molto dipende dal circuito ovvero dal tipo di monitoraggio che il circuito esegue sulle batterie.
Se il circuito monitora solo la tensione totale della serie, ti segnalerebbe che le batterie sono scariche quando la tensione totale è di 9.6V circa (3.2 x 3). Se le batterie sono tutte uguali (stessa storia) ciò capita quando ciascuna batteria arriva a circa 3.2V. Nel caso mdi di due vecchie ed una nuova, siccome le 2 vecchie si scaricano prima della nuova, tale situazione potrebbe verificarsi ad esempio quando le 2 vecchie sono a 3V e l nuova è a 3.6V: in pratica
si scaricano eccessivamente le vecchie e non si usa fino in fondo quella nuova.
Se invece il circuito monitora la tensione di ogni cella, allora ti segnala batterie scarica quando la più debole arriva a circa 3.2V evitando così di stressarla eccessivamente. Ciò non toglie che non sfrutterai appieno quella nuova.
Quindi in generale non è buona cosa mescolare batterie con storie diverse. L'entità di sovrastress sulle vecchie e di sottoutilizzo della nuova dipende da quanto diverse sono, ovvero da quanti cicli hanno già fatto le vecchie. Siccome le variazioni maggiori di prestazioni delle LiIon avvengono nei primi 50 cicli, direi molto approssimativamente che se le vecchie hanno già fatto 10/20 cicli non è il caso di mescolarle con una nuova. Sò che Mooch, il battery guru, stà studiando proprio questi aspetti e presto pubblicherà qualcosa.